ДНК оказалась почти всегда частично открытой
Нуклеосомы, которые отвечают за упаковку ДНК, чаще находятся не в стабильном, а в искаженном состоянии. К такому выводу пришли авторы исследования, опубликованного в журнале Nature.
Нуклеосома представляет собой участок ДНК длиной примерно 147 пар оснований, намотанный на белковый комплекс из гистонов. Ранее считалось, что такие структуры в основном закрывают ДНК от белков, регулирующих работу генов.
Согласно прежней модели, активность генов во многом зависела от того, открыт нужный участок ДНК или заблокирован нуклеосомами. Новые данные показывают, что эта система устроена сложнее.
Рекомендуем также:
- Хозяйки больше не варят свеклу часами: всего одна ложка на литр воды — и результат удивляет уже через 7 минут
- Ловушка для водителей уже работает: за какую деталь камеры начали массово выписывать штрафы и кто оказался вне зоны риска
Исследователи обнаружили частично развернутые и неполные формы нуклеосом. Такие состояния позволяют отдельным участкам ДНК оставаться доступными для взаимодействия с белками.
Для анализа ученые разработали метод IDLI. Он дает возможность изучать отдельные волокна хроматина и с высокой точностью определять доступность фрагментов ДНК.
С помощью этого подхода специалисты выяснили, что более 85 процентов нуклеосом в стволовых клетках мышей имеют искаженную структуру. Это означает, что доступ к генетической информации может сохраняться даже при наличии упаковки ДНК.
Искажения нуклеосом связаны с активностью генов и работой транскрипционных факторов. Среди таких белков исследователи выделяют CTCF, SOX2 и FOXA2.
Эти белки способны влиять на форму нуклеосом и тем самым участвовать в регулировании работы генов, а также в процессах развития клеток.
Авторы работы отмечают, что ДНК в клетке следует рассматривать не как неподвижную систему, а как постоянно меняющуюся структуру. Полученные результаты могут помочь лучше понять механизмы развития заболеваний, включая рак, и способы управления активностью генов.
Рекомендуем также:
